侯冠群在1995年與韓國航空空服員程皚薴Irene結婚，由中華民國國軍將領蔣緯國證婚，婚後長年分居，於2002傳出離婚。
在2008年宣布與交往六年的時任台北市議會議員兼中國國民黨團書記長李彥秀結婚，在陳雲林訪台期間舉行婚禮，原訂邀請與其舅舅黃孟復熟識十多年的時任中共中央臺灣工作辦公室主任陳雲林擔任主婚人，但以行程不便為由遭到拒絕，隔年兩人產下一女。
侯冠群 舅舅 黃孟復 生平
黃孟復（1944年1月—），男，漢族，上海人，中華人民共和國政治人物，中國民主建國會會員、中國共產黨黨員，現任中華全國工商業聯合會名譽主席。北京鋼鐵學院（現北京科技大學）冶金系鋼鐵冶金專業畢業，大學學歷，高級工程師。第八屆全國政協委員，第九屆全國政協常務委員。第十屆、第十一屆全國政協副主席。1967年9月參加工作。1968年從北京鋼鐵學院畢業後長期在南京鋼鐵廠工作，歷任工人、工長、技術員、工程師、煉鐵分廠技術科副科長、副廠長、高級工程師。1992年至1997年任南京市副市長、民建江蘇省委副主委、主委、南京市委主委。1997年至1998年任民建中央副主席，江蘇省委主委，南京市委主委，南京市副市長。1998年至2001年任民建中央副主席，江蘇省人大常委會副主任，民建江蘇省委主委、南京市委主委。2001年至2002年民建中央副主席，全國工商聯副主席，江蘇省人大常委會副主任，民建江蘇省委主委、南京市委主委。2002年任全國工商聯主席。2003年在全國政協十屆一次會議上當選為全國政協副主席；並於2008年3月連任。
家族
黃炎培之孫。黃孟復的外甥為台北市議員侯冠群。
黃炎培（1878年10月1日—1965年12月21日），字任之，號楚南，男，江蘇省川沙縣（今上海市浦東新區）人，近代中國教育家、商人、社會活動家、政治人物，中國民主同盟、中華職業教育社主要發起人之一。
黃炎培被普遍認為是近現代中國職業教育的重要創始人和理論家。